食品保健品洁净室（区）是在食品行业的原料加工、深加工生产的一门洁净技术的应用。食品行业的洁净室，除了控制空气中的微粒外，也对空气环境的微生物控制严格，在技术上防止微生物对食品的交叉污染。其中，像合景净化工程公司近期总承包建设的佛山立高食品几万方大型洁净厂房车间就最具代表性，该厂房车间是无菌包装，食品的无菌包装（如软包装鲜果汁、牛乳制品等等），是在洁净环境中完成包装工艺，在保持食品色、香、味、营养等方面大大优于一般的高温杀菌的罐装食品。除了食品洁净车间的无菌包装，空气洁净技术在食品酿造、发酵中也有很高的应用。

       食品保健品洁净室（区）的洁净等级参照医药工业洁净室，但比一般的洁净室要求要高，根据原来的现在已停止实行的美国联邦标准FS 209B具体细化可分为100级、1000级、10000级、100000级、3000000级，根据与ISO-14644是国际标准接轨的中国国家标准GB-50073有1～9级，原来的100级、1000级、10000级和100000级都是分别由被国际标准ISO-14644标准中的5级、6级、7级和8级所替代，这类洁净室（区）的洁净度等级1-8级，其中1～5级，气流流型为单向流或混合流，风速0.2～0.45m/s；6级气流流型为非单向流，换气次数50～60次/h；7级气流流型为非单向流，换气次数15～25次/h；8～9级气流流型为非单向流，换气次数10～15次/h。

       在这类食品厂房洁净室更注重卫生、安全，对车间内墙壁、天花板和门窗均应选用无毒、浅色、防水、防霉、不脱落、易于清洗的材料修建；墙角、地角、顶角应当具有弧度（曲率半径应不小于3cm）；车间内的操作台、传送带、运输车、工器具均用无毒、耐腐蚀、不生锈、易清洗消毒、坚固的材料制作。合景净化工程公司认为，这类型厂房洁净车间工程需在专业的规划设计期，以专业的施工技术，尽可能使完成的洁净室能给客户创造高品质价值和节能环保，而且，这类洁净室有很多余热等可回收的能源，对这类的洁净室有很多在节能方面的措施方案潜力挖掘。